杭州依云寺在寺庙规划设计及后期的建设中，首先是继承佛教建筑的诸多长处，突出时代特色，实现智能化、实用化、多功能化，建筑风貌达到与山与树和谐，实行房让树，保护树为原则，成为树包寺院的一大建筑特色。整个寺院在规划中注重环境绿化设计，力求使整个寺院花木葱绿，生机盎然，整洁安全、清净庄严、彰显人与众生和谐美景，为香客、游客提供了舒适、清静的活动环境。